Olimpiade Sains Nasional (OSN) adalah kegiatan yang dilaksanakan secara berkala setiap tahun sebagai ajang yang bergengsi tinggi di bidang akademik. Ajang ini berlanjut sampai ke tingkat internasional dengan seleksi yang sangat ketat. Alhamdulillah, siswa-siswa MAN Insan Cendekia Serpong setiap tahun dapat ikut serta dalam kontingen propinsi Banten sejak tahun 2002 untuk mengikuti olimpiade tingkat nasional. Tahun 2008 penyelenggaraan OSN diadakan di Makasar pada tanggal 8 – 14 Agustus, siswa MAN Insan Cendekia yang ikut serta ke tingkat nasional sejumlah 3 siswa, yaitu:

1. Emil Fahmi Yakhya (Astronomi)
2. Nadia Aulia Rahmi (Ekonomi)
3. Rizkia Lazuardina (Ekonomi)

Sejauh ini prestasi siswa yang mampu menembus ke ajang internasional adalah

1. Gufron Gozali tahun 2000 bidang kimia

2. Fajar Ardian tahun 2002 bidang fisika dan memperoleh medali emas.

3. Roswitha Muntiyarso Meraih Medali Perunggu IBO 2007 di Saskatoon, Canada

Ketiga prestasi tersebut sangat membanggakan, namun kiprah tersebut belum cukup mengibarkan nama Insan Cendekia di mata publik Indonesia.
Untuk itu, dengan segala upaya, program olimpiade sains ditangani secara serius untuk mampu mengejar prestasi semaksimal mungkin. Program pembinaan jelang olimpiade nasional disusun dengan melibatkan berbagai pihak yang dapat mendukung keberhasilan program, yaitu guru-guru Pembina Tim Olimpiade.
Dukungan dan motivasi dari berbagai pihak sangat diperlukan pihak madrasah agar program pembinaan berjalan lebih baik dan maksimal.